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Der Zoo wurde 1950 gegründet.

1953 übernahm die Stadt den bis dahin privaten Zoo.

Ab 1958 Ausbau eines neuen Geländes für den Zoo, 1960 Umzug des Tierbestandes.

1975 wurde der Hippo-Teil an den Pavillion für Nashörner und Tapire angebaut.

2005 wurde das Flußpferd das Wappentier des Zoos.

Am 20. 07. 2007 wurde das neue Außengehege für die Flußpferde in Betrieb genommen.

Von Januar 2010 bis März 2011 wurde das Flußpferdhaus saniert, die Flußpferde lebten vorübergehend im ehemaligen Nashornbereich.

Am 18. 03. 2011 wurde das renovierte Flußpferdhaus wieder für die Besucher freigegeben.

Der Flußpferdbereich wird Tanganjikasee genannt.

Im November 2017 kamen als freifliegende Mitbewohner Dreifarben-Glanzstare im Tanganjika-Pavillion dazu (1,5).

In Ostrava wird seit 2006 das ESB (Europäisches Zuchtbuch) für Flußpferde geführt.